2024

[45] Micro-second Time-resolved X-ray Single-molecule Internal Motions of SARS-CoV-2 Spike Variants
D. Sasaki, T. Arai, Y. Yang, M. Kuramochi, W. Furuyama, A. Nanbo, H. Sekiguchi, N. Morone, K. Mio, Y. C. Sasaki
Biochem. Biophys. Reports, 2024 (just accepted).

[44] Adenosine triphosphate induces amorphous aggregation of amyloid b by increasing Aβ dynamics
M. Kuramochi, M. Nakamura, H. Takahashi, T. Komoriya, T. Takita, Ngan T. Kim Pham, K. Yasukawa, K. Yoshimune
Scientific Reports, 14, 8134, 2024.

[43] タイヤゴム微粒子と高分子の X 線観測
佐々木裕次, 倉持昌弘
Colloid & Interface Communications, Vol.49, No.1, 2024. （査読なし）.

[42] 890 ナノ秒でタイヤゴム中のカーボン微粒子と高分子の動きを同時に観察
東京大学／茨城大学／住友ゴム工業㈱／（国研）産業技術総合研究所
月刊JETI, Vol. 72, No. 3, 2024（査読なし）.

[41] Real-time tilting and twisting motions of ligand-bound states of α7 nicotinic acetylcholine receptor
Y. Yang, T. Arai, D. Sasaki, M. Kuramochi, H. Inagaki, S. Ohashi, H. Sekiguchi, K. Mio, T. Kubo, Yuji C. Sasaki
European Biophys. J., doi: 10.1007/s00249-023-01693-6, 2024.

2023

[40] Ubiquitination of Major Histocompatibility Complex II Changes Its Immunological Recognition Structure
Y. Kozono, M. Kuramochi, Y. C. Sasaki, H. Kozono
Int. J. Mol. Sci., 24(23), 17083, 2023.

[39] Time-Resolved X-ray Observation of the Crystallized Protein in the Caenorhabditis elegans Cells
M. Kuramochi^{†, *}, I. Sugawara^†, Y. Shinkai, K. Mio, Y. C. Sasaki (^*corresponding author, ^†equally contribution)
Int. J. Mol. Sci., 24(23), 16914, 2023.

[38] Comparison of the molecular motility of tubulin dimeric isoforms: molecular dynamics simulations and diffracted X-ray tracking study
T. Yamane, T. Nakayama, T. Ekimoto, M. Inoue, K. Ikezaki, H. Sekiguchi, M. Kuramochi, Y. Terao, K. Judai, M. Saito, M. Ikeguchi, Y. C. Sasaki
Int. J. Mol. Sci., 24(20), 15423, 2023.

[37] The ice-binding site of antifreeze protein irreversibly binds to cell surface for its hypothermic protective function
Y. Yang, T. Arai, A. Yamauchi, S. Tsuda, M. Kuramochi, K. Mio, Y. C. Sasaki1
Biochem. Biophys. Res. Commun., 682, 343-348, 2023.

[36] Direct observation of 890 nano-second dynamics of carbon black and polybutadiene in rubber materials using diffracted X-ray blinking
M. Kuramochi^†*, H. J. Kirkwood^†, J. C. P. Koliyadu, R. Letrun, R. Wijn, C. Kim, T. Masui, K. Mio, T. Arai, H. Sekiguchi, H. Kishimoto, A. P. Mancuso, T. Sato*, Y. C. Sasaki* (^†equally contribution, *corresponding author)
Appl. Phys. Lett., 123, 101601, 2023.
メディアなど紹介記事
茨城大学, TRiSTAR, 東京大学, 産総研, 住友ゴム, JST, 日本経済新聞, ゴム報知新聞 vol.1, ゴム報知新聞 vol.2, ゴムタイムス 自動車春秋社, Tii技術情報, Motor-Fan Tech., TechEyesOnline, MONOist, Optinews, OPTRONICS,

[35] 氷晶結合タンパク質分子の構造特異機能に起因した凍結・低温耐性獲得メカニズム
倉持昌弘 、新井達也、三尾和弘、津田栄、佐々木裕次
アグリバイオ, 7(10), 72-77, 2023.（査読なし）

[34] Real-time observation of capsaicin-induced intracellular domain dynamics of TRPV1 using the diffracted X-ray tracking method
K. Mio, T. Ohkubo, D. Sasaki, T. Arai, M. Sugiura, S. Fujimura, S. Nozawa, H. Sekiguchi, M. Kuramochi, Y. C. Sasaki
Membranes, 13(8), 708, 2023.

[33] 凍結低温環境下での生命活動維持を実現する 氷晶結合タンパク質
倉持昌弘 、新井達也、三尾和弘、津田栄、佐々木裕次
アグリバイオ, vol7(5), 2023.（査読なし）

[32] Unraveling the Structural and Property Differences between Highly Similar Chiral and Racemic Crystals Composed of Analogous Molecules
K. Ishizaki, D. Takagi, T. Asahi, M. Kuramochi, T. Taniguchi
Crystal growth and design, 23, 7, 5330–5337, 2023.
カバーアートに選定されました！

[31] The effect of ice-binding proteins on the cryopreservation of Caenorhabditis elegan
M. Kuramochi*, T. Arai, K. Mio, S. Tsuda, Y. C. Sasaki
micropublication,10.17912/micropub.biology.000734, 2023.

[30] Observation of Molecular Motion in Polymer Thin Films by Laboratory Grazing Incidence Diffracted X-ray Blinking (GI-DXB)
R. Inamasu, H. Yamaguchi, T. Arai, J. Chang, M. Kuramochi, K. Mio, Y. C. Sasaki
Polymer Journal, https://doi.org/10.1038/s41428-023-00762-z, 2023.

2022

[29] 氷結合タンパク質は個体生物の凍結・非凍結低温環境における生存率を改善する
倉持昌弘 、新井達也、三尾和弘、津田栄、佐々木裕次
アグリバイオ, vol6(14), 64-69, 2022.（査読なし）

[28] Visualizing Intramolecular Dynamics of Membrane Proteins
T. Ohkubo, T. Shiina, K. Kawaguchi, D. Sasaki, R. Inamasu, Y. Yang, Z. Li, K. Taninaka, M. Sakaguchi, S. Fujimura, H. Sekiguchi, M. Kuramochi, T. Arai, S. Tsuda, Y. C. Sasaki, K. Mio
Int. J. Mol. Sci. 23(23), 14539, 2022.
Encyclopedia

[27] A mutation to a fish ice-binding protein synthesized in transgenic Caenorhabditis elegans modulates its cold tolerance
M. Kuramochi*, S. Zhu, C. Takanashi, Y. Yang, T. Arai, Y. Shinkai, M, Doi, K. Mio, S. Tsuda*, Y. C.Sasaki* (*corresponding author)
Biochemistry and Biophysics Research Communications, 628, 98-103, 2022.

[26] Dynamic observations of various oligomers in amyloid β isoforms using laboratory diffracted X-ray blinking
J. Chang, T. Arai, M. Kuramochi, R. Inamasu, Z. Lee, T. Ohkubo, K. Mio, Y. C. Sasaki
Biochemistry and Biophysics Reports, 31, 101298, 2022.

[25] Diffracted X-ray tracking method for measuring intramolecular dynamics of membrane proteins (Review article)
S. Fujimura, K. Mio, T. Ohkubo, T. Arai, M. Kuramochi, H. Sekiguchi, Y. C. Sasaki
Int. J. Mol. Sci., 23, 4, 2343, 2022.

[24] Dynamic Motions of Ice-Binding Proteins in Living Caenorhabditis elegans Using Diffracted X-ray Blinking and Tracking
M. Kuramochi*, Y. Dong, Y. Yang, T. Arai, R. Okada, Y. Shinkai, M. Doi, K. Aoyama, H. Sekiguchi, K. Mio, S. Tsuda, Y. C. Sasaki* (*corresponding author)
Biochemistry and Biophysics Reports, Volume 29, March 2022, 101224.

[23] Superelasticity of a photo-actuating chiral salicylideneamine crystal
T. Taniguchi, K. Ishizaki, D. Takagi, K. Nishimura, H. Shigemune, M. Kuramochi, Y. C. Sasaki, H. Koshima, T. Asahi
Commun. Chem., Vol.5, No.4, 2022.
プレス発表

2021

[22] 分子動態研究への挑戦：X線1分子追跡法によるTRPイオンチャネル制御機構の理解と構造情報との融合を目指して
三尾和弘, 藤村章子, 倉持昌弘, 関口博史, 佐々木裕次
放射光学会誌, Vol.34, No.5, 258-266, 2021.

[21] New Family Members of FG Repeat Proteins and Their Unexplored Roles During Phase Separation
Y. Shinkai*, M. Kuramochi*, T. Miyafusa* (*corresponding author)
Front. Cell and Develop. Biol., 9, 708702, 2021.

[20] Laboratory Diffracted X-ray Blinking to Monitor Picometer Motions of Protein Molecules and Application to Crystalline Materials
T. Arai*, R. Inamasu, H. Yamaguchi, D. Sasaki, A. Sato-Tomita, H. Sekiguchi, K. Mio, S. Tsuda, M. Kuramochi*, Y. C. Sasaki* (*corresponding author)
Structural Dynamics, 8, 044302, 2021.

[19] Living-cell diffracted X-ray Tracking Analysis confirmed Internal Salt Bridge is critical for Ligand Induced Twisting Motion of Serotonin Receptors
K. Mio, S. Fujimura, M. Ishihara, M. Kuramochi, H. Sekiguchi, T. Kubo, Y. C. Sasaki
Int. J. Mol. Sci. 22(10), 5285, 2021.

[18] Structural basis for the coiled-coil architecture of human CtIP
C. R. Morton, N. J. Rzechorzek, J. D. Maman, M. Kuramochi, H. Sekiguchi, Y. C. Sasaki, O. R Davies, L. Pellegrini
Open Biol., 11(6), 2021.

[17] Diffracted X-ray blinking measurements of interleukin 15 receptors in the inner/outer membrane of living NK cells
J. Chang, Y. Baek, I. Lee, H. Sekiguchi, K. Ichiyanagi, K. Mio, S. Nozawa, R. Fukaya, S. Adachi, M. Kuramochi*, Y. C. Sasaki* (*corresponding author)
Biochem. Biophys. Res. Commun., 556, 4, 53-58, 2021

[16] 線虫の凍結・低温耐性を改善する氷結合タンパク質の生体内作用機序の解明
倉持 昌弘、三尾 和弘、津田 栄、佐々木 裕次
月刊「細胞」2021年 4月号 温度による生命活動制御, Vol53, No4, 66-69, 2021（査読なし）

[15] 個体生物の凍結・低温耐性を改善する不凍タンパク質の生体内効果
倉持 昌弘、三尾 和弘、津田 栄、佐々木 裕次
月刊「アグリバイオ」2021年5月号　植物ペプチドの多様な生理機能と応用展開, 2021（査読なし）

[14] Tilting and rotational motions of silver halide crystal with diffracted X-ray blinking
M. Kuramochi*, H. Omata, M. Ishihara, S. Ø. Hanslin, M. Mizumaki, N. Kawamura, H. Osawa, M. Suzuki, K. Mio, H. Sekiguchi, and Y. C. Sasaki* (*corresponding author)
Scientific Reports, 11, 4097, 2021
プレスリリース

2020

[13] Agonist and antagonist diverted twisting motions of single TRPV1 channel
S. Fujimura, K. Mio, M. Kuramochi, H. Sekiguchi, K. Ikezaki, M. Mio, H. Kowit, Y. Shigeta, T. Kubo, Y. C. Sasaki
J. Phys. Chem. B, 124, 51, 11617–11624, 2020

[12] X-ray-based Living-cell Motion Analysis of Individual Serotonin Receptors
K. Mio, M. Ishihara, S. Fujimura, D. Sasaki, S. Nozawa, K. Ichiyanagi, R. Fukaya, S. Adachi, M. Kuramochi, H. Sekiguchi, T. Kubo, Y. C. Sasaki
Biochem. Biophys. Res. Commun., 529, 2, 306-313, 2020

2019

[11] 量子プローブを用いたタンパク質内部運動計測と電子顕微鏡構造解析の融合をめざして
三尾和弘，藤村章子，倉持昌弘，石原正輝，本田舞，三尾宗代，久保泰，関口博史，佐々木裕次
日本農薬学会誌（ミニレビュー）44(2), 210-215, 2019

[10] Expression of Ice-Binding Proteins in Caenorhabditis elegans Improves the Survival Rate upon Cold Shock and during Freezing
M. Kuramochi*, C. Takanashi, A. Yamauchi, M. Doi, K. Mio, S. Tsuda*, Y. C. Sasaki* (*corresponding author)
Scientific Reports, 9, 6246, 2019
プレスリリース

[9] An excitatory/inhibitory switch from asymmetric sensory neurons defines postsynaptic tuning for a rapid response to NaCl in Caenorhabditis elegans
M. Kuramochi, M. Doi
Front. Mol. Neurosci., 11, 484, 2019

[8] 線虫Ｃ．エレンガンスを用いた不凍タンパク質のin vivo解析
倉持昌弘，高梨千晶，山内彩加林，戸井基道，三尾和弘，津田栄，佐々木裕次
低温生物工学会誌, 65巻1号, 2019

2018

[7] X-ray observations of single bio-supramolecular photochirogenesis
J. Chang, M. Nishijima, H. Sekiguchi, K. Ichiyanagi, M. Kuramochi, Y. Inoue, Y. C.Sasaki
Biophysical Chemistry, 242, 1-5, 2018

[6] Diffracted X-ray Blinking Tracks Single Protein Motions
H. Sekiguchi, M. Kuramochi, K. Ikezaki, Y. Okamura, K. Yoshimura, K. Matsubara, J. W. Chang, N. Ohta, T. Kubo, K. Mio, Y. Suzuki, L. M. G. Chavas, Y. C. Sasaki
Scientific Reports, 8, 17090, 2018 プレスリリース

[5] Regulation of chromatin states and gene expression during HSN neuronal maturation is mediated by EOR-1/PLZF, MAU-2/cohesin loader, and SWI/SNF complex
Y. Shinkai, M. Kuramochi, M. Doi
Scientific Reports, 8, 7942, 2018

[4] A simple method for visualization of locus-specific H4K20me1 modifications in living Caenorhabditis elegans single cells
Y. Shinkai, M. Kuramochi, M. Doi
G3: GENES, GENOMES, GENETICS, 8, 7, 2249-2255, 2018

2017年以前

[3] A Computational Model Based on Multi-Regional Calcium Imaging Represents the Spatio-Temporal Dynamics in a Caenorhabditis elegans Sensory Neuron
M. Kuramochi, M. Doi
PLOS ONE, 12(1):e0168415, 2017

[2] 線虫C. elegansの味覚神経活動の時空間動態解析
倉持 昌弘, 戸井 基道
電子情報通信学会技術研究報告. NC, ニューロコンピューティング 114(515) 169-172, 2015（査読なし）

[1] Quantitative modeling of neuronal dynamics in C. elegans
M. Kuramochi, Y. Iwasaki
Neural Information Processing. Theory and Algorithms, Lecture Notes in Computer Science6443, 17-24, 2010

1.特願2020-122717（出願日：2020/07/17, 整理番号：2020000127）
発明の名称：Ｘ線を用いた物質評価方法及び物質評価装置
佐々木裕次（東大・産総研）、倉持昌弘（東大）、三尾和弘（産総研）

[16] 機械学習を用いたX線透過動画からの高分子材料の動態物性評価
(公財)コニカミノルタ科学技術振興財団 令和５年度コニカミノルタ画像科学奨励賞
2024年4月 - 2025年3月
倉持 昌弘（研究代表者）

[15] 先進情報解析を用いた物質動態のX線ブリンキング計測
(公財)島津科学技術振興財団 2023年度研究開発助成
2024年4月 - 2025年3月
倉持 昌弘（研究代表者）

[14] 氷晶結合分子の構造特異機能の解明および生体保存技術への展開
茨城大学 Research Booster
2023年9月 - 2024年3月
倉持 昌弘（研究代表者）

[13] X線を用いた高速１分子運動解析による膜タンパク質オペランド計測の実現
科研費 基盤B
2023年4月 - 2025年3月
倉持 昌弘（研究分担者）

[12] 凍結低温制御分子の構造特異機能の解明および個体丸ごと保存技術の開発
JST ACT-X「環境とバイオテクノロジー」
2022年10月 - 2025年3月
倉持 昌弘（研究代表者）

[11] 文科省「世界で活躍できる研究者育成事業」TRiSTARフェロー制度
2022年9月 - 2025年3月
倉持 昌弘（研究代表者）

[10] 原子スケールの動的特性を検出する微分X線ブリンキング法の開発 - 生体分子から無機・有機・高分子材料まで -
公益財団法人 総合工学振興財団 研究助成
2022年9月 - 2023年3月
倉持 昌弘（研究代表者）

[9] 個体生物の細胞内反応場およびタンパク質分子の回転揺らぎピコメートルX線計測
公益財団法人中谷医工計測技術振興財団 技術開発研究助成【開発研究】
2022年4月 - 2023年3月
倉持 昌弘（研究代表者）

[8] 生体内氷晶のＸ線ナノスケール観測に基づいた不凍タンパク質多細胞系凍結保存法の確立
日本学術振興会 科学研究費助成事業 若手研究
2021年4月 - 2023年3月
倉持 昌弘（研究代表者）

[7] 時分割回折X線ブリンキングによるソフトクリスタル動的特性観測
日本学術振興会 科学研究費助成事業 新学術領域研究(研究領域提案型)
新学術「ソフトクリスタル：高秩序で柔軟な応答系の学理と光機能」
2020年4月 - 2022年3月
倉持 昌弘（研究代表者）

[6] 線虫Ｃ．エレガンスにおける凝集タンパク質および分子夾雑場のX線１分子観察
日本学術振興会 科学研究費助成事業 新学術領域研究(研究領域提案型)
新学術「分子夾雑の生命化学」
2020年4月 - 2022年3月
倉持 昌弘（研究代表者）

[5] 線虫 C. エレガンスのシナプス伝達実測データに基づく理論モデル構築
日本神経回路学会 日本神経回路学会 30周年記念研究助成金
2021年2月 - 2022年2月
倉持 昌弘（研究代表者）

[4] 線虫の低温耐性を改善する不凍タンパク質の生体内作用機序の解明
日本学術振興会 科学研究費助成事業 若手研究
2019年4月 - 2021年3月
倉持 昌弘（研究代表者）

[3] 時分割回折X線ブリンキングによる線虫の不凍タンパク質動態の検出
公益財団法人日本科学協会 笹川科学研究助成
2020年4月 - 2021年2月
倉持 昌弘（研究代表者）

[2] 生きた線虫の１分子動態と細胞応答を同時取得する時分割Ｘ線回折／細胞イメージング法
公益財団法人中谷医工計測技術振興財団 技術開発研究助成【奨励研究】
2019年4月 - 2020年3月
倉持 昌弘（研究代表者）

[1] 蛍光生体イメージングと計算機シミュレーションによる線虫神経の時空間活動解析
日本学術振興会 科学研究費助成事業 特別研究員奨励費 (DC2)
2016年4月 - 2017年3月 (2017年度辞退)
倉持 昌弘（研究代表者）

2019年8月 線虫研究の未来を創る会2019 ネクストリーダー賞

2015年12月 DAILAB CAFE-PLUS series 03 Best Presentation Award (runner-up)

2014年11月 The Irago Conference 2014 Best Presentation Award (Graduate Student Session)

2011年6月 日本学生支援機構 大学院第一種奨学金 特に優れた業績による返還免除

2011年3月 OIST 英文懸賞論文入選

2011年1月 7th Asia Biophysics Association (ABA) Symposium ABA Travel Award